項(xiàng)目簡介：
RNA 甲基化指發(fā)生在RNA 分子上不同位置的甲基化修飾現(xiàn)象，常見的RNA轉(zhuǎn)錄后修飾方式有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A) 和5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine，m5C)等。
新研究發(fā)現(xiàn)，m6A修飾在調(diào)控基因表達(dá)、剪接、RNA 編輯、RNA 穩(wěn)定性、控制mRNA壽命和降解、介導(dǎo)環(huán)狀RNA翻譯等方面扮演重要角色。因此meRIP-seq助力解決細(xì)胞分化，生物發(fā)育、疾病發(fā)展，熱休克反應(yīng)等生物學(xué)問題。
利用甲基化RNA共沉淀結(jié)合高通量測序 (Methylated RNA Immunoprecipitation sequening，MeRIP-seq)技術(shù)，可以對RNA轉(zhuǎn)錄后甲基化修飾圖譜進(jìn)行全面研究，是表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的關(guān)鍵技術(shù)。

項(xiàng)目流程：
甲基化RNA共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation，MeRIP)基于抗體特異性結(jié)合甲基化修飾的堿基的原理，以RNA共沉淀富集甲基化修飾片段為基礎(chǔ)，然后通過高通量測序，在全轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)研究發(fā)生甲基化的RNA區(qū)域，獲得結(jié)果。



客戶提供：
1、活細(xì)胞：培養(yǎng)細(xì)胞至60－80％密度，然后加滿培養(yǎng)基寄給公司；
2、物種信息（人、大小鼠物種，其他物種需評估）

基本分析內(nèi)容：
1、 原始數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)
2、過濾后數(shù)據(jù)質(zhì)量QC 圖
3、測序序列與參考基因組比對
4、基因組覆蓋度分布
5、Peak Calling 分析
6、Peak 可視化
7、Peak 統(tǒng)計(jì)分析
8、m6A 的基本特征
8.1 peak 在基因元件的分布
8.2 reads 在基因元件的分布
8.3 Peak 關(guān)聯(lián)基因的特征
9、差異peak 分析
10、 motif分析

分析內(nèi)容：
環(huán)狀RNA關(guān)聯(lián)分析

推薦閱讀：RNA甲基化修飾（m6A）研究技術(shù)及方案設(shè)計(jì)

參考文獻(xiàn)：
X, et al.N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability.Nature. 2014;505(7481):117-20.
2.Liu N, et al.N(6)-methyladenosine-dependent RNA structural switches regulate RNA-protein interactions.Nature. 2015;518(7540):560-4.
3.Yang Y, Fan X, Mao M, et al. Extensive translation of circular RNAs driven by N6-methyladenosine[J]. Cell Research, 2017.

查看全部介紹